Российская академия наук



страница579/848
Дата10.12.2019
Размер1.98 Mb.
1   ...   575   576   577   578   579   580   581   582   ...   848
Россохин А.В.

Федеральное государственное бюджетное учреждение «Научный центр неврологии»


РАМН, Москва, Россия; alrossokhin@yahoo.com
В настоящее время для изучения структуры и функций различных ионных каналов активно используется методика молекулярного моделирования. GABAA рецепторы (GABAAR) являются трансмембранными белками, опосредующими процессы быстрого торможения в центральной нервной системе. Мы построили модели трансмембранного домена (ТМД) GABAAR 122 конфигурации со стехиометрическим соотношением субъединиц 2:2:1, основанные на гомологии с никотиновым ацетилхолиновым рецептором (nAChR), бактериальным лиганд-управляемым рецептором (GLIC) и глютамат-управляемым хлорным каналом (GluCl). ТМД каждой субъединицы состоит из четырех трансмембранных -спиральных сегментов (М1-М4) и большой цитоплазматической петли М3-М4. Пору GABAAR формируют пять сегментов М2, относящихся к различным субъединицам.

Степень гомологичности ТМД GABAAR с nAChR, GLIC и GluCl, определенная нами по результатам выравнивания аминокислотных последовательностей белков, составляет 18, 26 и 44%, соответственно. Таким образом, GluCl является наиболее перспективным прототипом для моделирования GABAAR. Выравнивание М2 спиралей проводили относительно расположенных в N-терминальной части консервативных остатков Arg (GABAAR) и Lys (nAChR). В случае гомопентамерных каналов GLIC и GluCl

выравнивание М2 осуществляется по остаткам Arg-245 (GluCl) и Asn-223 (GLIC). Однако в отличие от nAChR эти остатки оказываются не в начале спирали, а на четыре остатка выше, что приводит к отличию аминокислотного состава спиралей М2 в моделях GABAA_nAChR, с одной стороны, и GABAA_GLIC, GABAA_GluCl, с другой стороны.

Мы проиллюстрировали эти особенности моделей на примере связывания структурно-различных неконкурентных блокаторов поры GABAAR: -лактамного антибиотика пенициллина G (PNG) и нифлумовой кислоты (NFA), относящейся к классу фенаматов. Мы рассчитали энергетические профили PNG и NFA в поре моделей GABAA_nAChR, GABAA_GLIC и GABAA_GluCl. Различия в расположении энергетических минимумов коррелируют с отличиями в аминокислотном составе М2 сегментов.



Работа выполнена при финансовой поддержке гранта РФФИ 12-04-00304 и гранта Президента по поддержке Научных школ НШ-3598.2012.4.
COMPARATIVE ANALYSIS OF THE MODELS OF GABAA RECEPTOR PORE BUILT ON THE BASIS OF STRUCTURES OF NICOTINIC ACETYLCHOLINE RECEPTOR (nAChR), BACTERIAL LIGAND-GATED RECEPTOR (GLIC) AND GLUTAMATE-GATED CHLORIDE CHANNEL (GLuCl)


Каталог: news
news -> Умеренные когнитивные нарушения у больных с сосудистым поражением головного мозга 14. 01. 11 нервные болезни
news -> 15-й международный медицинский форум «качество и безопасность оказания медицинской помощи» нижегородская ярмарка россия, Нижний Новгород
news -> Сборник материалов
news -> Разработка технологии вкусоароматических добавок с применением сенсорных технологий
news -> «казұму 85 жыл: жетістіктері мен келешегі» халықаралық ғылыми-тəжірибелік конференция аясындағы «клиникалық фармация: халықаралық ТƏжірибе мен қазақстанның денсаулық сақтаудағы даму ерекшеліктері»
news -> Программа международной научно-практической конференции 14-15 апреля 2016 г. Курск 2016
news -> Российская академия наук отделение физиологических наук


Поделитесь с Вашими друзьями:
1   ...   575   576   577   578   579   580   581   582   ...   848


База данных защищена авторским правом ©zodorov.ru 2017
обратиться к администрации

    Главная страница